La pand\u00e9mie de la Covid-19 est la plus grande crise de sant\u00e9 publique depuis plus d\u2019un si\u00e8cle et s\u2019est propag\u00e9e \u00e0 travers le monde en quelques semaines. De m\u00eame, la quantit\u00e9 de donn\u00e9es scientifiques sur la Covid-19 a augment\u00e9 de fa\u00e7on exponentielle, ce qui a conduit \u00e0 des discussions quotidiennes entre experts et non experts sur les cas, les d\u00e9c\u00e8s et o\u00f9 pourrait nous emmener cette pand\u00e9mie.
\nLa Tunisie n\u2019\u00e9chappe pas \u00e0 la r\u00e8gle et la pand\u00e9mie de la Covid-19 a amen\u00e9 beaucoup de monde, de diff\u00e9rents profils, \u00e0 se lancer dans des tentatives d\u2019interpr\u00e9tations de donn\u00e9es brutes fournies par les sources officielles de l\u2019Etat ou des estimations\/pr\u00e9visions publi\u00e9es par des sites internationaux concernant la Covid-19. Avec le temps et devant les h\u00e9sitations de la strat\u00e9gie de communication des pouvoirs publics, ayant conduit \u00e0 un manque de confiance dans les chiffres officiels publi\u00e9s, m\u00eame des scientifiques \u00e9clair\u00e9s, des acad\u00e9miciens, y compris du monde m\u00e9dical, ont commenc\u00e9 \u00e0 se r\u00e9f\u00e9rer \u00e0 des analyses d\u00e9velopp\u00e9es par des statisticiens non sp\u00e9cialis\u00e9s qui ont cru \u00eatre capables de d\u00e9chiffrer la situation, voire m\u00eame de juger les strat\u00e9gies en place et d\u2019en pr\u00e9coniser d\u2019autres.
\nCette d\u00e9rive est certainement un des d\u00e9r\u00e8glements g\u00e9n\u00e9r\u00e9s par la pand\u00e9mie et qui ont touch\u00e9 tous les modes de fonctionnement de notre vie. En effet, la pand\u00e9mie est responsable d\u2019une panique g\u00e9n\u00e9rale qui a impact\u00e9 le comportement de tout un chacun dans sa vie priv\u00e9e et professionnelle.
\nUn autre ph\u00e9nom\u00e8ne est venu faciliter l\u2019expression de cette d\u00e9rive. Il s\u2019agit du comportement des mass-m\u00e9dias, en comp\u00e9tition pour couvrir le d\u00e9roulement de la pand\u00e9mie en temps r\u00e9el afin d\u2019assouvir la curiosit\u00e9 du grand public accroch\u00e9 aux \u00e9crans et aux sites d\u2019information. L\u2019absence de donn\u00e9es scientifiques d\u2019\u00e9vidence vis-\u00e0-vis d\u2019un ph\u00e9nom\u00e8ne totalement nouveau et l\u2019av\u00e8nement d\u2019autres m\u00e9dias alternatifs profitant du ph\u00e9nom\u00e8ne (blogs, r\u00e9seaux sociaux…) ont ouvert la voie \u00e0 l\u2019apparition sur les plateaux des m\u00e9dias et des sites d\u2019informations de pr\u00e9tendants chroniqueurs et\/ou experts qui se permettent d\u2019utiliser des donn\u00e9es publi\u00e9es, sans aucun discernement et sans aucun respect des r\u00e8gles d\u00e9ontologiques et \u00e9thiques, notamment celle de se limiter \u00e0 son champ disciplinaire pour \u00e9mettre un avis expert, de l\u2019obligation de v\u00e9rifier toutes informations utilis\u00e9es et de leur v\u00e9racit\u00e9 scientifique et au respect du devoir de l\u2019anonymat en ce qui concerne les donn\u00e9es personnelles.
\nAu milieu de ce brouillard d\u2019informations, des termes qui n\u2019\u00e9taient auparavant connus que des scientifiques tr\u00e8s sp\u00e9cialis\u00e9s, tels que R (nombre de reproduction de base), les mod\u00e8les de simulation, le test RT\/PCR, les tests de diagnostic rapides ou encore le taux d\u2019incidence ou taux de l\u00e9talit\u00e9 font soudain partie des conversations quotidiennes dans de nombreux cercles non sp\u00e9cialis\u00e9s. D\u2019o\u00f9 l\u2019importance de rappeler les r\u00e8gles de bonne pratique dans le domaine de l\u2019utilisation et de l\u2019interpr\u00e9tation des donn\u00e9es scientifiques se rapportant \u00e0 la sant\u00e9 humaine.
\nLa discipline qui s\u2019occupe de la collecte, de l\u2019interpr\u00e9tation et de la valorisation des donn\u00e9es sanitaires s\u2019appelle l\u2019\u00e9pid\u00e9miologie. L\u2019\u00e9pid\u00e9miologie est un domaine scientifique qui va au-del\u00e0 de la manipulation simple ou simpliste des chiffres, des cas et des d\u00e9c\u00e8s. Tout comme un m\u00e9decin praticien est un expert en m\u00e9decine ou un virologue expert en virologie, un \u00e9pid\u00e9miologiste utilise sa science de traitement des donn\u00e9es pour orienter la lutte contre les probl\u00e8mes de sant\u00e9 \u00e0 port\u00e9e communautaire (maladies chroniques, sant\u00e9 de la m\u00e8re et de l\u2019enfant, sant\u00e9 environnementale, sant\u00e9 bucco-dentaire, maladies canc\u00e9reuses\u2026). L\u2019\u00e9pid\u00e9miologie qui s\u2019applique aux maladies \u00e9pid\u00e9miques s\u2019appelle \u00ab \u00e9pid\u00e9miologie d\u2019intervention \u00bb. Son r\u00f4le est de diriger la riposte aux \u00e9pid\u00e9mies depuis l\u2019investigation jusqu\u2019\u00e0 la riposte et en arrivant aux strat\u00e9gies de consolidation des r\u00e9sultats (contr\u00f4le, \u00e9limination ou \u00e9radication). Cette branche de l\u2019\u00e9pid\u00e9miologie a connu, ces vingt derni\u00e8res ann\u00e9es, un d\u00e9veloppement acc\u00e9l\u00e9r\u00e9 pour faire face au d\u00e9fi des maladies nouvelles et \u00e9mergentes (SRAS, West Nile, H5N1, H1N1, Ebola\u2026). Ses outils et ses m\u00e9thodes se sont renouvel\u00e9s et son enseignement s\u2019est consolid\u00e9 pour renforcer les comp\u00e9tences des \u00e9pid\u00e9miologistes sp\u00e9cialis\u00e9s dans la lutte contre les maladies transmissibles. L\u2019OMS recommande que dans chaque pays, il faut avoir au moins un \u00e9pid\u00e9miologiste d\u2019intervention pour 100 000 habitants afin de pouvoir disposer de suffisamment de sp\u00e9cialistes capables de diriger la riposte aux \u00e9pid\u00e9mies locales.
\nTrois exemples montrent combien ces analystes, qui s\u2019\u00e9rigent en \u00e9pid\u00e9miologistes, n\u2019ont pas conscience de leurs erreurs en chevauchant avec un champ disciplinaire qui n\u2019est pas le leur, qu\u2019ils ne ma\u00eetrisent pas :<\/p>\n
1. Ils ne savent pas que construire un graphique, une courbe \u00e0 partir d\u2019une s\u00e9rie arithm\u00e9tique est compl\u00e8tement diff\u00e9rent de la construction d\u2019une courbe \u00e9pid\u00e9mique, premi\u00e8re \u00e9tape pour l\u2019\u00e9pid\u00e9miologiste pour confirmer une \u00e9pid\u00e9mie, caract\u00e9riser son type et d\u00e9finir la strat\u00e9gie ad\u00e9quate pour son contr\u00f4le :
\nLa courbe \u00e9pid\u00e9mique est le premier livrable de l\u2019\u00e9pid\u00e9miologiste lors de l\u2019investigation d\u2019une \u00e9pid\u00e9mie. Il la construit \u00e0 partir d\u2019une collecte des donn\u00e9es guid\u00e9e par des r\u00e8gles bien \u00e9tablies ob\u00e9issant \u00e0 des normes scientifiques. D\u2019abord, une collecte des variables temps, lieu, personne pour tous les premiers cas rapport\u00e9s. A partir de ces donn\u00e9es, une d\u00e9finition de cas (cas suspect, cas probable et cas confirm\u00e9) est \u00e9tablie et imm\u00e9diatement utilis\u00e9e pour aller rechercher (case tracing) tous les autres cas responsables ou g\u00e9n\u00e9r\u00e9s autour des premiers cas d\u00e9couverts et afin de remonter jusqu\u2019au cas index. L\u2019allure de la courbure construite \u00e0 partir de ces donn\u00e9es (c\u2019est le d\u00e9but des sympt\u00f4mes et non la date d\u2019apparition du cas qui sont utilis\u00e9s pour tracer la courbe) met en \u00e9vidence la date exacte du d\u00e9but de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie, la r\u00e9partition des cas dans le temps et permet de poser des hypoth\u00e8ses sur la p\u00e9riode d\u2019incubation, le mode de transmission, la source pr\u00e9sum\u00e9e de la maladie et \u00e0 partir de l\u00e0, recommander la strat\u00e9gie de contr\u00f4le. Ensuite la courbe des cas cumul\u00e9s permet de suivre l\u2019\u00e9volution dans le temps de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie et l\u2019impact des mesures de contr\u00f4le mises en \u0153uvre. Ces m\u00e9thodes appliqu\u00e9es \u00e0 la construction de la courbe et son caract\u00e8re de courbe des valeurs cumul\u00e9es garantit \u00e0 l\u2019\u00e9pid\u00e9miologiste la capacit\u00e9 de pouvoir interpr\u00e9ter sur une base quotidienne, hebdomadaire ou mensuelle l\u2019\u00e9volution de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie. Ces outils et ces m\u00e9thodes font partie des techniques sp\u00e9cifiques \u00e0 l\u2019\u00e9pid\u00e9miologie et ne sont enseign\u00e9s nulle part, par une autre discipline.<\/p>\n
2. Ils ne savent pas que l\u2019analyse des tendances d\u2019une s\u00e9rie chronologique est compl\u00e9tement diff\u00e9rente du monitoring d\u2019une pouss\u00e9e \u00e9pid\u00e9mique bas\u00e9e sur l\u2019utilisation d\u2019outils sp\u00e9cifiques difficiles \u00e0 estimer par les m\u00e9thodes usuelles de la statistique g\u00e9n\u00e9rale :
\nEn effet, les tendances du nombre de cas, m\u00eame ceux ajust\u00e9s en fonction des chiffres de population, ne sont pas suffisantes pour bien comprendre l\u2019\u00e9volution d\u2019une \u00e9pid\u00e9mie. La charge absolue de la maladie est \u00e9galement importante : une baisse de 10% dans 10 000 cas est tr\u00e8s diff\u00e9rente d\u2019une baisse de 10% dans 100 cas. Le niveau de d\u00e9pistage par les tests est \u00e9galement d\u2019une consid\u00e9ration importante, car les tendances des cas peuvent augmenter ou diminuer artificiellement si le niveau de d\u00e9pistage change de mani\u00e8re significative. De m\u00eame, le nombre de personnes susceptibles au fil du temps doit \u00eatre pris en compte lors de l\u2019utilisation des taux de cas. Si les cas par habitant diminuent de 10% dans un endroit o\u00f9 la moiti\u00e9 des personnes se sont \u00e9loign\u00e9es au cours de la m\u00eame p\u00e9riode, la propagation r\u00e9elle de la maladie est probablement en augmentation et non en baisse. Pour saisir avec pr\u00e9cision les risques pour la communaut\u00e9, nous devons consid\u00e9rer des informations suppl\u00e9mentaires sur les cas et leurs modes de transmission, leur localisation et l\u2019application effective des mesures de contr\u00f4le telles que l\u2019isolement des cas et la mise en quarantaine des contacts. De telles informations sont n\u00e9cessaires \u00e0 l\u2019interpr\u00e9tation des tendances et ne sont disponibles que chez les \u00e9pid\u00e9miologistes charg\u00e9s de la surveillance, qui les observent et les collectent sur le terrain dans des conditions souvent tr\u00e8s difficiles, en contexte de propagation \u00e9pid\u00e9mique. S\u2019exposerait au risque de se tromper celui qui croit qu\u2019\u00e0 partir d\u2019une simple information collect\u00e9e sans effort, dont il ne peut m\u00eame corriger les erreurs ou les fautes de transcription ou de discordance, il peut tirer des conclusions, faire des critiques ou \u00e9chafauder des sc\u00e9narios.
\nPour les \u00e9pid\u00e9miologistes d\u2019intervention, R est le meilleur param\u00e8tre \u00e0 utiliser pour suivre la tendance d\u2019une \u00e9pid\u00e9mie. Le nombre de reproduction effectif (Rt) est simple \u00e0 comprendre mais difficile \u00e0 estimer, notamment pour les non-initi\u00e9s \u00e0 ces m\u00e9thodes statistiques compliqu\u00e9es et qui contournent ces difficult\u00e9s en cherchant \u00e0 emprunter d\u2019autres techniques non adapt\u00e9es (temps de doublement des cas). Ce chiffre repr\u00e9sente le nombre attendu d\u2019infections secondaires r\u00e9sultant d\u2019une seule personne infect\u00e9e. Si la valeur de Rt est sup\u00e9rieure \u00e0 1, la propagation de la maladie augmente. Si Rt est inf\u00e9rieur \u00e0 1, la propagation de la maladie diminue. Un simple score qui montre \u00e0 quelle vitesse le coronavirus se propage est une id\u00e9e s\u00e9duisante. Il n\u2019y a pas de m\u00e9thode standard pour estimer R et les estimations ont g\u00e9n\u00e9ralement une part d\u2019incertitude en raison de la notification tardive des cas. C\u2019est l\u2019\u00e9pid\u00e9miologiste qui domine sa base de donn\u00e9es et qui est le seul capable de travailler sur des donn\u00e9es consolid\u00e9es pour r\u00e9duire la part d\u2019incertitude et s\u2019approcher des valeurs r\u00e9elles afin de bien orienter les pouvoirs publics sur les mesures \u00e0 mettre en place pour contr\u00f4ler l\u2019\u00e9pid\u00e9mie.<\/p>\n
3. Ils ne savent pas que les mesures \u00e0 recommander \u00e0 partir d\u2019une analyse de tendance classique ne ressemblent en rien aux d\u00e9ductions d\u2019un \u00e9pid\u00e9miologiste qui met en \u0153uvre une strat\u00e9gie bas\u00e9e sur l\u2019investigation de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie et qui observe ses effets en temps r\u00e9el :
\nL\u2019incidence des cas est un bon indicateur du risque communautaire mais le nombre de nouveaux cas dans une population (taux d\u2019incidence) ne refl\u00e8te pas toujours le risque r\u00e9el de transmission dans une communaut\u00e9. La raison principale est que la composition ou la distribution de ces cas peut \u00eatre tr\u00e8s diff\u00e9rente, m\u00eame si le total global est le m\u00eame. Il peut \u00e9galement y avoir un regroupement significatif d\u2019\u00e9v\u00e9nements \u00ab cluster de cas \u00bb qui entra\u00eenent une transmission locale. Le risque d\u2019entrer en contact avec une personne infectieuse dans une communaut\u00e9 o\u00f9 les cas sont regroup\u00e9s (cluster) en un lieu donn\u00e9 est beaucoup plus faible que dans une communaut\u00e9 o\u00f9 la r\u00e9partition des cas est plus diversifi\u00e9e sur le plan d\u00e9mographique et g\u00e9ographique. Avant de livrer ses conclusions \u00e0 partir des outputs de son syst\u00e8me de surveillance, l\u2019\u00e9pid\u00e9miologiste interpr\u00e8te ces r\u00e9sultats en prenant en consid\u00e9ration plein d\u2019autres param\u00e8tres, notamment ceux qui se rapportent \u00e0 l\u2019application des strat\u00e9gies de contr\u00f4le pr\u00e9conis\u00e9es qui varient selon le lieu. De telles informations sont disponibles dans d\u2019autres bases de donn\u00e9es auxquelles il faudra acc\u00e9der pour compl\u00e9ter l\u2019analyse des donn\u00e9es. Un graphique construit \u00e0 partir de donn\u00e9es fig\u00e9es n\u2019offre pas cette garantie.
\nQuant \u00e0 la pol\u00e9mique autour de la d\u00e9claration des cas d\u00e9c\u00e8s par Covid-19, qui a retenti jusqu\u2019aux plateaux des t\u00e9l\u00e9visions ces deniers temps, on peut souligner que dans les syst\u00e8mes de signalement des d\u00e9c\u00e8s, les d\u00e9c\u00e8s dus \u00e0 Covid-19 sont sous-estim\u00e9s pour plusieurs raisons, notamment la capacit\u00e9 limit\u00e9e de testing qui conduit souvent \u00e0 une sous-d\u00e9tection des personnes infect\u00e9es, et une grande partie des d\u00e9c\u00e8s survenant dans la communaut\u00e9 – par opposition aux h\u00f4pitaux – peuvent ne pas \u00eatre attribu\u00e9s \u00e0 la Covid-19. L\u2019autre probl\u00e9matique pos\u00e9e par les statistiques des d\u00e9c\u00e8s est li\u00e9e au d\u00e9calage entre l\u2019apparition du cas et la survenue du d\u00e9c\u00e8s. Ce d\u00e9calage fait des d\u00e9c\u00e8s un reflet de la situation plusieurs semaines avant le moment o\u00f9 ils sont signal\u00e9s. Selon les meilleures estimations, il faut en moyenne environ 28 jours entre le d\u00e9but des sympt\u00f4mes et la survenue du d\u00e9c\u00e8s. Ce d\u00e9lai peut varier consid\u00e9rablement d\u2019un pays \u00e0 un autre et d\u2019une personne \u00e0 l\u2019autre. Compte tenu de ce d\u00e9calage, les d\u00e9c\u00e8s ne sont pas un bon indicateur pour surveiller si la situation de la maladie s\u2019aggrave ou s\u2019am\u00e9liore. Concr\u00e8tement, il faudrait attendre plusieurs semaines avant de d\u00e9tecter tout changement. Enfin, la surmortalit\u00e9, ou l\u2019\u00e9cart entre les d\u00e9c\u00e8s actuels et la moyenne historique, est une meilleure mesure de l\u2019impact global de la Covid-19. Cela inclut ceux qui meurent directement ou indirectement \u00e0 cause de la pand\u00e9mie. Au total, le monitoring par la courbe \u00e9pid\u00e9mique et le calcul du Rt sont beaucoup plus utiles pour \u00e9valuer l\u2019impact des mesures de contr\u00f4le.
\nLa contribution de toutes les parties vives du pays dans le d\u00e9bat sur la gestion de la pand\u00e9mie est souhaitable et tr\u00e8s certainement profitable pour corriger les erreurs. Pour qu\u2019il en soit ainsi, il conviendrait que chacun s\u2019appuie sur sa science ou discipline d\u2019expertise pour \u00e9viter de s\u2019embarquer dans de fausses interpr\u00e9tations nuisibles et sans int\u00e9r\u00eat.
\nLes enseignements de cette premi\u00e8re exp\u00e9rience avec la Covid doivent nous servir pour pr\u00e9parer le futur, la pand\u00e9mie continuant \u00e0 nous d\u00e9fier pour une plus ou moins longue p\u00e9riode encore. La Tunisie est en phase de pr\u00e9paration pour lancer une campagne de vaccination contre la Covid-19. Le seul salut pour notre pays, pour se remettre sur pied et revenir \u00e0 un mode de vie normale, est la r\u00e9alisation d\u2019une couverture vaccinale assez \u00e9lev\u00e9e conf\u00e9rant \u00e0 la population une immunit\u00e9 collective suffisante emp\u00eachant le virus de circuler faute de trouver assez de cibles immunologiquement na\u00efves. Dans un contexte encore plein d\u2019incertitudes scientifiques vis-\u00e0-vis du virus et du vaccin pouvant g\u00e9n\u00e9rer refus ou h\u00e9sitation \u00e0 la vaccination, la r\u00e9ussite de la prochaine campagne de vaccination d\u00e9pendra de la qualit\u00e9 de la campagne de communication qui la pr\u00e9c\u00e8dera. Chacun de nous pourrait jouer un r\u00f4le \u00e0 ce niveau, en portant le message ad\u00e9quat et\/ou en \u00e9vitant de faire \u00e9cho aux informations fausses et aux fausses croyances qui risquent d\u2019emp\u00eacher l\u2019adh\u00e9sion de la population \u00e0 ce seul espoir qui nous fera gagner la bataille contre cette pand\u00e9mie d\u00e9vastatrice.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
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